根据餐厨垃圾蛋白饲料生产线工艺流程要求选择主要设备有预处理设备、发酵设备以及制粒设备。
  1.预处理设备
  预处理设备主要包括分选设备、餐厨垃圾专用破碎机，餐厨垃圾脱水机。预处理系统能够有效控制餐厨垃圾粒径、含水率等因素，加快后续发酵处理效率及得到较好的成品外观性。
 分选设备是用来将餐厨垃圾中各种组成成分进行分类的机械设备，以提高原料的纯度。选择分选设备应考虑物料的形状、尺寸、整体密度、含水率及黏结性，其材料必须耐腐蚀、易清洗，运行能耗低、噪声小、可靠性高。餐厨垃圾分选通常采用平面振动筛。
  脱水设备主要是指餐厨垃圾脱水机、专用压缩脱水机，能够使餐厨垃圾内的水分充分排出。其材质应选用耐磨、防腐蚀材料，并能调节含水率。选用脱水设备应着重考虑脱水设备的运行费用与操作管理水平。
  2.发酵设备
  在工业上应用的固态发酵反应器是圆盘式、转鼓式及搅拌式。旋转圆盘式发酵机是目前国内较为先进的新型固态发酵设备。转鼓式固态发酵反应器适用于固态发酵的特点，可满足充足的通风和温度控制。反应器配有搅拌轴、料气进出口及接种口等，培养基灭菌、接种、干燥等均可在发酵器内进行，可有效防止杂菌污染，恒温水浴控制发酵温度，恒温冷水喷雾冷却转鼓，发酵过程中，温度波动小，机械化程度较高。
  搅拌式反应器有立式和卧式之分。固态发酵反应器将物料的混合、灭菌、冷却、接种、发酵几个工艺过程集中在一个工位完成，避免了物料的搬动，保证微生物生长所需的环境条件并有效防止了杂菌污染。固态发酵反应器要有良好的搅拌、通气、散热、冷却系统，能够进行无菌操作，能够控制发酵过程中的温湿度和水分等，同时应便于清洗消毒、费用低等，这是选型时需考虑的关键因素。
  3.制粒设备
  制粒机是饲料生产中最关键的设备之一。制粒机主要由调速喂料器、调质筒、压粒室和蒸汽系统4部分组成。选型时对其性能的评定主要从结构设计的合理性、操作方便程度、结构参数的选择、加工手段、制造水平、零部件选材、进货渠道及控制功能等几方面来综合考虑。
  根据设备生产上的适用性原则，主要设备的选择可以选择成套餐厨垃圾处理设备，以保证生产能顺利进行。生物发酵制蛋白饲料生产技术是一种新兴的餐厨垃圾资源化技术。要使该技术真正发挥作用，形成规模化生产，这有赖于垃圾分类制度的进一步完善，同时对饲料产品的安全性，尤其是有可能导致动物疫病流行的问题应引起足够的重视，要开展这方面的研究工作，并尽快制定再生饲料产品的安全标准并采取措施加以落实。